مهارت آموزی آنالیز داده های NGS
(DNA & RNA sequencing)
آزمایشگاه ژنیران برگزار کننده دوره کارآموزی نیمه خصوصی (کارگاه) آنالیز داده های NGS
(DNA & RNA sequencing) می باشد.
۱۰۰ ساعت در ۲۰ جلسه
نصب تمامی نرم افزارهای مورد نیاز در طول دوره بر روی لپ تاپ شخصی کارآموزان
سیستم عامل های دوره: لینوکس و نرم افزار R
کلاس های این دوره به صورت نیمه خصوصی (۵ تا ۸ نفره) برگزار میگردد.
با اعطای مدرک از آزمایشگاه ژنیران-انجمن زیست‌شناسی ایران و ITE لندن (در صورت درخواست)
شروع دوره:
- ۳۰ آبان
- هزینه دوره: ۱۵ میلیون و ۵۰۰ هزار تومان
برای ثبت نام کافیست فقط ۲۵ درصد هزینه کل را بپردازید. ۷۵ درصد باقی مانده را می توانید در اقساط ۳ ماهه با چک صیادی پرداخت کنید. اطلاعات بیشتر
سرفصل های دوره کارآموزی آنالیز داده های NGS:
- مروری بر توالی یابی نسل بعد ،کاربردها و انواع آن (بررسی پلتفرم ها)
- آموزش Linux essential و آشنایی با محیط R
- آنالیز مرحله اول (Primary Analysis) داده های NGS شامل Filtering و Trimming و معرفی فایل FASTQ
- آنالیز مرحله دوم (Secondary Analysis) داده های NGS و Alignment آن با ژنوم مرجع
- تبدیل فایل FASTQ به فایل های SAM و BAM
- Variant Calling و کنترل کیفی آن
- آنالیز مرحله سوم (Tertiary Analysis) شامل Annotation
- Filtering و Prioritization واریانت ها
- تفسیر نتایج براساس گایدلاین ACMG
- آنالیز توالی یابی سنگر
- RNA Sequencing
The course entitled “Next-Generation Sequencing Data Analysis” at Geniran laboratory covers following topics
Overview and Common Applications of NGS Technologies
Linux Essential
Library Preparation for NGS
Data Analysis for NGS:
Primary Analysis (FASTQ Filtering and Trimming)
Secondary Analysis (FASTQ Alignment, Post Alignment, Variant Calling)
Tertiary Analysis (Annotation, Filtering and Prioritization)
CNV Analysis by Read-Depth Approach
American College of Medical Genetics (ACMG) guidelines for the interpretation and reporting of SNV and CNVs in routine diagnostics
Analysis of Sanger Sequencing
RNA Sequencing and Analysis
از طرفی حجم عظیم داده های ایجاد شده از توالی یابی نیاز روزافزون استفاده از کامپیوتر و برنامه نویسی را در تجزیه و تحلیل و مدیریت داده ها سبب شد. این امر به نوبه خود ایجاد علم بین رشته ای بیوانفورماتیکی را سبب شد که دانستن آن امروزه برای دانشجویان و متقاضیان کار در این حیطه امری ضروری بوده چرا که به کمک این علم دروازه ای جدید از بررسی داده ها در وسعت زیاد و در نتیجه تحقق نتیجه قطعی تر و نزدیک تر به واقعیت را در سطح کل ژنوم فراهم می آورد.
آزمایشات مولکولی مبتنی بر توالی یابی نسل بعد (NGS) ، در تشخیص بیماری های تک ژنی، پزشکی سازی شخصی، ارزیابی ریسک و درمان بیماران مبتلا به سرطان انقلاب عظیمی ایجاد کرده است. همچنین از این علم در حوزه های دیگری همچون آنالیز بیان ژن و مطالعه تغییرات اپی ژنتیکی شامل متیلاسیون DNA، تعامل بین پروتئین ها با DNA و بررسی رونوشت های RNA در حال ترجمه با Ribosome Profiling استفاده می شود.
آزمایشگاه ژنیران با برگزاری کارآموزی NGS | دوره آموزشی NGS | امکان یادگیری یک علم بین رشته ای نوین که در آن تکنیک های کامپیوتری همچون کار در محیط لینوکس، نصب نرم افزارهای مربوطه، انجام گام به گام آنالیز داده های حجیم (big data) و در نهایت ارائه یک گزارش بالینی از پروسه انجام شده را برای افراد فراهم می آورد. از مزیت های مهم این دوره علاوه بر یادگیری و انجام آنالیزWhole Exome Sequencing (WES) و بررسی و تشخیص واریانت های تک ژنی بررسی واریانت های ساختاری همچون CNV ها می باشد.
همین طور در این دوره به منظور درک بهتر کارآموزان رشته های بیولوژی از مباحث کامپیوتری مقدمه ای در رابطه با برنامه نویسی آموزش داده خواهد شد. همچنین این امکان وجود خواهد داشت تا دانشجویان علاوه بر کار با سرور انجام آنالیز با کامپیوتر شخصی خود را نیز فرا گیرند. از برتری های این دوره نسبت به سایر دوره های مشابه یادگیری انجام آنالیز در سطح transcriptome و بررسی بیان ژن ها با تکنیک RNA seq می باشد.
افرادي که مسلط به آناليز داده های (Next-Generation Sequencing) NGS هستند، مي‌توانند در آزمايشگاه‌هاي ژنتيک، کارخانه‌هاي داروسازي و مراکز تحقيقاتي فعاليت کنند. همچنين دانشجویان کوشا و علاقه مند در نهایت می توانند در انجام پروژه های آنالیز با مجموعه ژنیران همکاری کنند.
سلام
من میخوام این دوره رو شرکت کنم
ولی ساکن تهران نیستم !
و برام مقدور نیست هر جمعه بیام تهران ،
ایا ممکن نیست که این دوره در روزهای پشت سر هم برگزار بشه یا مقداری از دوره انلاین باشه؟
سلام دوست عزیز
ما برای عزیزانی که از شهرستان تشریف می آوردند خوابگاه در نظر داریم و شما میتوانید کلاس ها را به صورت حضوری شرکت کنید.
لطفا جهت کسب کسب اطلاعات بیشتر با آزمایشگاه تماس بگیرید تا کارششناسان ما تبه شما کمک کنند.
سلام. ببخشید این دوره چند روز در هفته و روزی چند ساعت برگزار میشه؟
سلام دوست عزیز
این دوره در آخر هفته ها برگزار میشه و یک تا دو روز در هفته است. لطفا جهت اطلاعات بیشتر و مشاوره رایگان با آزمایشگاه تماس بگیرید.
سلام. وقت بخیر. برای ورود به بازارکار این دوره کفایت می‌کند؟
امکان برگزاری در دی ماه وجود ندارد؟
سلام دوست عزیز
این دوره یک دوره تخصصی است که در صورتی که دانش پایه قوی داشته باشید برای شما مفید خواهد بود همچنین شما میتوانید جهت مشاروه رایگان و تخصصی با آزمایشگاه تماس بگیرید.
ببخشین با منتور است؟
سلام بله لطفا با آزمایشگاه برای اطلاعات بیشتر تماس بگیرید.
سلام دوره NGS چند روز است و هزینه دوره چقدر است؟
سلام دوست عزیز
این دوره ۸۰ ساعت ۱۱ جلسه است با هزینه ۷ میلیون تومان. همچنین آخر هفته ها برگزار میشه . جهت اطلاعات بیشتر لطفا با ژنیران تماس بگیرید.
سلام
وقت بخیر
شما دوره آنلاین آنالیز NGS هم دارید؟
سلام دوست عزیز بله در حال حاضر این دوره برگزار میشود و شما میتوانید آنالیز NGS را با استاد برجسته یادبگیرید. لطفا جهت اطلاعات بیشتر با ما تماس بگیرید یا اینکه روی لینک زیر کلیک کنید تا برای شما اطلاعات دوره کارآموزی NGS به نمایش دربیاد.
کارآموزی آنالیز داده های NGS
سلام آموزش در محیط لینوکس انجام میشود؟ باید روی سیستم خودمان نصب بشه؟ یا توی سرور هست؟
سلام دوست عزیز در سیستم خودتان باید لینوکس نصب کنید.
سلام،
آیا امکان برگزاری دوره آموزشی آنالیز داده های NGS بصورت غیر حضوری (آفلاین یا انلاین) وجوددارد؟
با تشکر
سلام دوست عزیز متاسفانه خیر امکان این وجود ندارد اما به زودی ویدیئو های آموزشی در هر سرفصل قرار خواهد گرفت.
درود – برای دوره NGS تماس گرفتم. میخواستم ببینم که کی دوره شروع میشه ؟
و تخفیفات دوره به چه صورت هست ؟
ممنونم.
سلام دوست عزیز
درصورتی که معدل الف باشید 10درصد و درصورتی که جزو خانواده ایثارگران باشید هم 10 درصد تخفیف، برای شما اعمال میشود.دوره بعدی در 4 آذر و دوره زمستانی در21 بهمن برگزار خواهد شد.لطفا جهت اطلاعات بیشتر با ژنیران تماس بگیرید.
سلام وقت بخیر دوره چند روزه هستش؟پیش نیاز دوره چی هست؟ من تو آزمایشگاه ژنتیک کار میکنم ولی در دوره بعد میخوام شرکت کنم برای آمادگی قبل از شروع دوره مطالبی هست بگین مطالعه کنیم بعد حضور داشته باشیم برای یادگیری بهتر
سلام دوست عزیز
این دوره، یک دوره تخصصی است که پیشنیاز آن دانستن مباحث بیوانفورماتیک و ژنتیک میباشد.این دوره جمعه ها برگزار میشود.
لطفا جهت اطلاعات بیشتر با آزمایگشاه تماس بگیرید.
سلام شما میتوانید خلاطه لودیش و کتاب خلاصه بیوشیمی لنینجر را مطالعه فرمایید همچنین مطالعه درسنامه های هر دوره که در سایت برای شما قرار دادیم برای شرکت در دوره کافی است.
سلام . دوره غیرحضوری هم برای NGS دارید؟
سلام خیر
سلام
کلاس این دوره برگزار شده
سلام من دانشجوی کارشناسی میکروبیولوژی هستم میتونم در رابطه با انالیز ngs مشغول به کار بشم ؟! یا فقط اونایی که مهندسی کامپیوترند میتونند؟!
سلام بله بسته به مهارت شما میتونید وارد بازار کار بشید
سلام وقت بخیر
اموزش در این دوره در چه حدی هست؟ ایا پس از پایان دوره قادر به انالیز نتایج بالینی هستیم؟
سلام در این دوره به صورت کامل انالیز دیتا ها بهتون اموزش داده میشود