مهارت آموزی آنالیز داده های NGS
(DNA & RNA sequencing)
آزمایشگاه ژنیران برگزار کننده دوره کارآموزی نیمه خصوصی (کارگاه) آنالیز داده های NGS
(DNA & RNA sequencing) می باشد.
۱۰۰ ساعت در ۲۰ جلسه
نصب تمامی نرم افزارهای مورد نیاز در طول دوره بر روی لپ تاپ شخصی کارآموزان
سیستم عامل های دوره: لینوکس و نرم افزار R
کلاس های این دوره به صورت نیمه خصوصی (۵ تا ۸ نفره) برگزار میگردد.
با اعطای مدرک از آزمایشگاه ژنیران-انجمن زیست‌شناسی ایران و ITE لندن (در صورت درخواست)
شروع دوره:
- ۲۷ تیر
- هزینه دوره: ۱۵ میلیون و ۵۰۰ هزار تومان
برای ثبت نام کافیست فقط ۲۵ درصد هزینه کل را بپردازید. ۷۵ درصد باقی مانده را می توانید در اقساط ۳ ماهه با چک صیادی پرداخت کنید. اطلاعات بیشتر
سرفصل های دوره کارآموزی آنالیز داده های NGS:
- مروری بر توالی یابی نسل بعد ،کاربردها و انواع آن (بررسی پلتفرم ها)
- آموزش Linux essential و آشنایی با محیط R
- آنالیز مرحله اول (Primary Analysis) داده های NGS شامل Filtering و Trimming و معرفی فایل FASTQ
- آنالیز مرحله دوم (Secondary Analysis) داده های NGS و Alignment آن با ژنوم مرجع
- تبدیل فایل FASTQ به فایل های SAM و BAM
- Variant Calling و کنترل کیفی آن
- آنالیز مرحله سوم (Tertiary Analysis) شامل Annotation
- Filtering و Prioritization واریانت ها
- تفسیر نتایج براساس گایدلاین ACMG
- آنالیز توالی یابی سنگر
- RNA Sequencing
The course entitled “Next-Generation Sequencing Data Analysis” at Geniran laboratory covers following topics
Overview and Common Applications of NGS Technologies
Linux Essential
Library Preparation for NGS
Data Analysis for NGS:
Primary Analysis (FASTQ Filtering and Trimming)
Secondary Analysis (FASTQ Alignment, Post Alignment, Variant Calling)
Tertiary Analysis (Annotation, Filtering and Prioritization)
CNV Analysis by Read-Depth Approach
American College of Medical Genetics (ACMG) guidelines for the interpretation and reporting of SNV and CNVs in routine diagnostics
Analysis of Sanger Sequencing
RNA Sequencing and Analysis
از طرفی حجم عظیم داده های ایجاد شده از توالی یابی نیاز روزافزون استفاده از کامپیوتر و برنامه نویسی را در تجزیه و تحلیل و مدیریت داده ها سبب شد. این امر به نوبه خود ایجاد علم بین رشته ای بیوانفورماتیکی را سبب شد که دانستن آن امروزه برای دانشجویان و متقاضیان کار در این حیطه امری ضروری بوده چرا که به کمک این علم دروازه ای جدید از بررسی داده ها در وسعت زیاد و در نتیجه تحقق نتیجه قطعی تر و نزدیک تر به واقعیت را در سطح کل ژنوم فراهم می آورد.
آزمایشات مولکولی مبتنی بر توالی یابی نسل بعد (NGS) ، در تشخیص بیماری های تک ژنی، پزشکی سازی شخصی، ارزیابی ریسک و درمان بیماران مبتلا به سرطان انقلاب عظیمی ایجاد کرده است. همچنین از این علم در حوزه های دیگری همچون آنالیز بیان ژن و مطالعه تغییرات اپی ژنتیکی شامل متیلاسیون DNA، تعامل بین پروتئین ها با DNA و بررسی رونوشت های RNA در حال ترجمه با Ribosome Profiling استفاده می شود.
آزمایشگاه ژنیران با برگزاری کارآموزی NGS | دوره آموزشی NGS | امکان یادگیری یک علم بین رشته ای نوین که در آن تکنیک های کامپیوتری همچون کار در محیط لینوکس، نصب نرم افزارهای مربوطه، انجام گام به گام آنالیز داده های حجیم (big data) و در نهایت ارائه یک گزارش بالینی از پروسه انجام شده را برای افراد فراهم می آورد. از مزیت های مهم این دوره علاوه بر یادگیری و انجام آنالیزWhole Exome Sequencing (WES) و بررسی و تشخیص واریانت های تک ژنی بررسی واریانت های ساختاری همچون CNV ها می باشد.
همین طور در این دوره به منظور درک بهتر کارآموزان رشته های بیولوژی از مباحث کامپیوتری مقدمه ای در رابطه با برنامه نویسی آموزش داده خواهد شد. همچنین این امکان وجود خواهد داشت تا دانشجویان علاوه بر کار با سرور انجام آنالیز با کامپیوتر شخصی خود را نیز فرا گیرند. از برتری های این دوره نسبت به سایر دوره های مشابه یادگیری انجام آنالیز در سطح transcriptome و بررسی بیان ژن ها با تکنیک RNA seq می باشد.
افرادي که مسلط به آناليز داده های (Next-Generation Sequencing) NGS هستند، مي‌توانند در آزمايشگاه‌هاي ژنتيک، کارخانه‌هاي داروسازي و مراکز تحقيقاتي فعاليت کنند. همچنين دانشجویان کوشا و علاقه مند در نهایت می توانند در انجام پروژه های آنالیز با مجموعه ژنیران همکاری کنند.
سلام.وقتتون بخیر.کلاسها کجا و به چه صورت برگزار میشه؟
سلام در آزمایشگاه ژنیران در مفتح جنوبی بصورت حضوری
دوره ی جدید کی هست؟
اطلاعات مربوط به تاریخ شروع دوره در همین صفحه موجود است.
این دوره NGSمناسب چه رشته هایی هست
جهت مشاورره رایگان با ما تماس بگیرید
ایا این دوره پیش نیاز دارد؟
بخش پیش نیاز دوره در همین صفحه را مطالعه کنید
کارگاه انالیز ngs بصورت انلاین هم برگزار میکنید؟
خیر این دوره حضوری است
سلام وقت بخیر من تازه دوره کاراموزی ژنتیک مولکولی رو تموم کردم می‌تونم این دوره رو ثبت‌نام کنم؟ امکان ثبت‌نام آنلاین برای این دوره وجود دارد؟
سلام، این دوره به علت تخصصی و غیر عمومی بودن ثبت نام آنلاین ندارد و قبل از ورود به کلاس باید با شما مصاحبه شود. جهت اطلاعات بیشتر با ما تماس بگیرید
سلام وقتتون بخیر.آیا کلاس به صورت آنلاین هم تشکیل میشه؟ و این که چند جلسه در هفته هست؟آخر هفته هاست؟
خیر آنلاین برگزار نمیشود و کاملا حضوری است