اخبار علمی, مطالب
بیش از 140،000 گونه ویروسی جدید در روده انسان شناسایی شدند
ویروس ها بیشترین موجودات بیولوژیکی روی کره زمین هستند. اکنون محققان موسسه Wellcome Sanger و موسسه بیوانفورماتیک اروپا EMBL (EMBL-EBI) بیش از 140،000 گونه ویروسی را که در روده انسان زندگی می کنند شناسایی کرده اند که بیش از نیمی از آنها قبلاً هرگز دیده نشده اند.
این مطالعه که 18 فوریه 2021 در ژورنال Cell منتشر شده است، حاوی تجزیه و تحلیل بیش از 28000 نمونه میکروبیوم روده است که از مناطق مختلف جهان جمع آوری شده است. تعداد و تنوع ویروس هایی که محققان کشف کردند به طرز شگفت آوری زیاد بود.
روده انسان یک محیط بیولوژیکی فوق العاده است. علاوه بر باکتری ها ، صدها هزار ویروس به نام باکتریوفاژها که می توانند باکتری ها را آلوده کنند نیز در آنجا زندگی می کنند.
تحقیقات نشان داده اند که عدم تعادل در میکروبیوم روده می تواند به بیماری ها و شرایط پیچیده ای مانند بیماری های التهابی روده ، آلرژی و چاقی منجر شود.
با استفاده از روش تعیین توالی DNA به نام متاژنومیکس، محققان موسسه Wellcome Sanger و موسسه بیوانفورماتیک اروپا EMBL (EMBL-EBI) تنوع زیستی گونه های ویروسی را که در 28060 متاژنوم روده عموم انسان ها و 2898 ژنوم ایزوله باکتریایی کشت شده از روده را کشف و فهرست بندی کردند.
در تجزیه و تحلیل های انجام شده، بیش از 140000 گونه ویروسی ساکن روده انسان شناسایی شدند که بیش از نیمی از آن ها قبلاً هرگز دیده نشده اند.
دکتر الکساندر آلمیدا ، فوق دکترا در EMBL-EBI و موسسه Wellcome Sanger ، بیان کرد: “موضوع حائز اهمیت این است که همه ویروس ها مضر نیستند ، بلکه آن ها نیز یک جز جدایی ناپذیر از اکوسیستم روده هستند. بیشتر ویروس هایی که کشف شدند به عنوان ماده ژنتیکی خود DNA دارند ، که با اکثر عوامل بیماری زایی که مردم می شناستد متفاوتند مانند ویروس SARS-CoV-2 یا Zika ، که ویروس های RNA دار هستند. همچنین این نمونه ها عمدتا از افراد سالم تهیه شده است که هیچ بیماری خاصی ندارند. اینکه چندین گونه ناشناخته در روده ما زندگی می کنند و تلاش برای حل رابطه همزیستی بین آن ها و سلامت انسان بسیار جالب است. ”
در میان ده ها هزار ویروس کشف شده ، یک کلاد بسیار شایع – گروهی از ویروس ها که گمان می رود یک جد مشترک دارند – شناسایی شدند که نویسندگان از آن به عنوان Gubaphage یاد می کنند. این کلاد جدید به عنوان دومین ویروس شایع روده انسانی شناخته شد. اولین ویروس شایع crAssphage است که در سال 2014 کشف شد.
به نظر می رسد هر دو این ویروس ها انواع مشابهی از باکتری های روده انسان را آلوده می کنند ، اما بدون تحقیقات بیشتر، شناخت دقیق عملکرد گوبافاژ که اخیراً کشف شده است، دشوار است.
دکتر لوئیس اف. کاماریلو-گوئررو ، اولین نویسنده این مقاله از موسسه ولکوم سانگر بیان کرد: “یک جنبه مهم کار ما این بود که اطمینان حاصل کنیم ژنوم ویروسی بازسازی شده از بالاترین کیفیت برخوردار است. ژنوم های ویروسی با کیفیت بالا، راه را برای درک بهتر نقش ویروس ها در میکروبیوم روده هموار می کنند.
نتایج حاصل از این مطالعه، اساس پایگاه داده های فاژ های روده ای (GPD) است. یک پایگاه داده بسیار منظم که حاوی 142809 ژن فاژ غیر زاید می باشد و منبع ارزشمندی برای کسانی است که باکتریوفاژها را مطالعه می کنند.
دکتر Trevor Lawley ، نویسنده ارشد این مطالعه از موسسه Wellcome Sanger ، گفت: “تحقیقات بر روی باکتریوفاژ در حال حاضر دچار رونسانس و تجدید است. این کاتالوگ با کیفیت بالا و در مقیاسی بزرگ از ویروس های روده انسانی، در زمانی مناسب در اختیار محققان قرار می گیرد تا به عنوان یک نقشه اصلی، مطالعات ویروسی آینده را در تجزیه و تحلیل زیست محیطی و تکاملی راهنمایی کند.
ویروس ها بیشترین موجودات بیولوژیکی روی کره زمین هستند. اکنون محققان موسسه Wellcome Sanger و موسسه بیوانفورماتیک اروپا EMBL (EMBL-EBI) بیش از 140،000 گونه ویروسی را که در روده انسان زندگی می کنند شناسایی کرده اند که بیش از نیمی از آنها قبلاً هرگز دیده نشده اند.
این مطالعه که 18 فوریه 2021 در ژورنال Cell منتشر شده است، حاوی تجزیه و تحلیل بیش از 28000 نمونه میکروبیوم روده است که از مناطق مختلف جهان جمع آوری شده است. تعداد و تنوع ویروس هایی که محققان کشف کردند به طرز شگفت آوری زیاد بود.
روده انسان یک محیط بیولوژیکی فوق العاده است. علاوه بر باکتری ها ، صدها هزار ویروس به نام باکتریوفاژها که می توانند باکتری ها را آلوده کنند نیز در آنجا زندگی می کنند.
تحقیقات نشان داده اند که عدم تعادل در میکروبیوم روده می تواند به بیماری ها و شرایط پیچیده ای مانند بیماری های التهابی روده ، آلرژی و چاقی منجر شود.
با استفاده از روش تعیین توالی DNA به نام متاژنومیکس، محققان موسسه Wellcome Sanger و موسسه بیوانفورماتیک اروپا EMBL (EMBL-EBI) تنوع زیستی گونه های ویروسی را که در 28060 متاژنوم روده عموم انسان ها و 2898 ژنوم ایزوله باکتریایی کشت شده از روده را کشف و فهرست بندی کردند.
در تجزیه و تحلیل های انجام شده، بیش از 140000 گونه ویروسی ساکن روده انسان شناسایی شدند که بیش از نیمی از آن ها قبلاً هرگز دیده نشده اند.
دکتر الکساندر آلمیدا ، فوق دکترا در EMBL-EBI و موسسه Wellcome Sanger ، بیان کرد: “موضوع حائز اهمیت این است که همه ویروس ها مضر نیستند ، بلکه آن ها نیز یک جز جدایی ناپذیر از اکوسیستم روده هستند. بیشتر ویروس هایی که کشف شدند به عنوان ماده ژنتیکی خود DNA دارند ، که با اکثر عوامل بیماری زایی که مردم می شناستد متفاوتند مانند ویروس SARS-CoV-2 یا Zika ، که ویروس های RNA دار هستند. همچنین این نمونه ها عمدتا از افراد سالم تهیه شده است که هیچ بیماری خاصی ندارند. اینکه چندین گونه ناشناخته در روده ما زندگی می کنند و تلاش برای حل رابطه همزیستی بین آن ها و سلامت انسان بسیار جالب است. ”
در میان ده ها هزار ویروس کشف شده ، یک کلاد بسیار شایع – گروهی از ویروس ها که گمان می رود یک جد مشترک دارند – شناسایی شدند که نویسندگان از آن به عنوان Gubaphage یاد می کنند. این کلاد جدید به عنوان دومین ویروس شایع روده انسانی شناخته شد. اولین ویروس شایع crAssphage است که در سال 2014 کشف شد.
به نظر می رسد هر دو این ویروس ها انواع مشابهی از باکتری های روده انسان را آلوده می کنند ، اما بدون تحقیقات بیشتر، شناخت دقیق عملکرد گوبافاژ که اخیراً کشف شده است، دشوار است.
دکتر لوئیس اف. کاماریلو-گوئررو ، اولین نویسنده این مقاله از موسسه ولکوم سانگر بیان کرد: “یک جنبه مهم کار ما این بود که اطمینان حاصل کنیم ژنوم ویروسی بازسازی شده از بالاترین کیفیت برخوردار است. ژنوم های ویروسی با کیفیت بالا، راه را برای درک بهتر نقش ویروس ها در میکروبیوم روده هموار می کنند.
نتایج حاصل از این مطالعه، اساس پایگاه داده های فاژ های روده ای (GPD) است. یک پایگاه داده بسیار منظم که حاوی 142809 ژن فاژ غیر زاید می باشد و منبع ارزشمندی برای کسانی است که باکتریوفاژها را مطالعه می کنند.
دکتر Trevor Lawley ، نویسنده ارشد این مطالعه از موسسه Wellcome Sanger ، گفت: “تحقیقات بر روی باکتریوفاژ در حال حاضر دچار رونسانس و تجدید است. این کاتالوگ با کیفیت بالا و در مقیاسی بزرگ از ویروس های روده انسانی، در زمانی مناسب در اختیار محققان قرار می گیرد تا به عنوان یک نقشه اصلی، مطالعات ویروسی آینده را در تجزیه و تحلیل زیست محیطی و تکاملی راهنمایی کند.
