یکی از روش های مطالعه ی ترانسکریپتوم که براساس تکنولوژی های نسل جدید توالی یابی انجام می شود، روش RNA-seq می باشد. RNA-seq یک تکنیک تجربی مهیج است که برای کاوش و یا تعیین کمیت بیان ژن تحت شرایط مختلف مورد استفاده قرار می گیرد.
همانطور که می دانیم ، ژن ها دستورالعمل هایی برای ساخت پروتئین ها ارائه می دهند، پروتئین هایی که عملکردی در سلول دارند. اگرچه همه سلولها دارای توالی DNA یکسانی هستند ، اما سلولهای عضلانی به دلیل ژنهای مختلفی که در این سلولها روشن شده و RNA ها و پروتئینهای مختلف تولید شده از سلولهای عصبی و انواع دیگر سلولها متفاوت است.