بافرهای PCR چه هستند؟
یک سیستم بافری مطلوب برای انجام موفقیت آمیز واکنش PCR ضروری است. نتایج قابل اطمینان PCR به عوامل زیادی بستگی دارد: کیفیت DNA و پرایمر ها و همچنین ابزار های دخیل در PCR.
PH مناسب برای واکنش PCR، 8 الی 9.5 است که توسط Tris – HCl موجود در بافر
بافر مبتنی بر Tris مختلفی برای PCR های مختلف تهیه شده است. این بافر ها در غلظت 10X آماده می شود و همراه با MgCl2 15 میلی مولار عرضه می شوند.
برای راحتی کار هم می توان بافر را به تنهایی به صورت تجاری تهییه کرد و هم می توان ترکیب آماده مسترمیکس را تهییه کرد که خود بافر را درونش دارد. از انواع بافر های تجاری موجود در بازار می توان به موارد زیر اشاره کرد:
- بافر 10 برابر آمونیوم
- بافر استاندارد 10 برابر
- بافر ترکیبی 10 برابر
- 5x PCR Buffer RED
- 4x GC Buffer I & 4x GC Buffer II
- PCR Grade Water
- محلول تقویت کننده بتائین 5 M
اجزای اصلی بافر PCR عبارتند از:
- TRIS – HCl به منظور حفظ شرایط پایدار PH
- یون منیزیم دوبار مثبت که کوفاکتور آنزیم پلیمراز است.
- KCl که با یونیزه ضدن در محیط واکنش اتصال اسید نوکلئیک با پرایمر و نوکلئوتید ها را تسهیل می کند.
- ژلاتین برای غلظت دادن به واکنش