آشنایی با NCBI (بانک های اطلاعاتی و نرم افزارها)

NCBI and Gene database

 

 

آشنایی با NCBI : با تکمیل پروژه ی ژنوم انسان، یکی از اهداف مهم بیوانفورماتیک که تحلیل توالی ها می باشد، محقق شد. اما رفته  رفته با پیشرفت هایی که در زمینه ی بیوانفورماتیک حاصل شد، احساس نیاز به یک پایگاه داده که تمام اطلاعات مربوط به توالی ژن ها و پروتئین ها را ذخیره و نگهداری کند، بیشتر نمایان شد. علم بیوانفورماتیک با بهره گیری از پایگاه های داده ی متعدد و نرم افزار های مختلف، امکان بررسی ساختار، عملکرد، تفاوت های توالی های متعدد به منظور مطالعات تکاملی و … را فراهم می نماید. تا به امروز اطلاعات مربوط به توالی های موجودات مختلف در پایگاه های داده ذخیره و برای اهداف گوناکون در اختیار محققین قرار گرفته است. همانطور که اشاره شد، حفظ و نگهداری انبوه اطلاعات ژنتیکی به منظور دسترسی سریع محققین نیازمند پایگاه داده های زیستی یا بانک اطلاعاتی است. از جمله پایگاه های داده ی اصلی می توان به GeneBank، EMBL و DDBJ اشاره نمود که به ترتیب پایگاه داده ی GeneBank توسط مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی آمریکا ((NCBI واقع در انستیتو ملی سلامت (NIH) مدیریت می شود. پایگاه داده ی EMBL توسط انستیتو بیوانفورماتیک اروپا (EBI) اداره می شود و پایگاه داده ی DNA (DDBJ) توسط انستیتو ملی ژنتیک ژاپن اداره می شود. این پایگاه های داده به گونه ای طراحی شده اند که افزودن یا به روز کردن اطلاعات حتی توسط کاربران نیز امکان پذیر می باشد، لذا اطلاعات یا داده های جدید هر 24 ساعت بین این سه پایگاه داده اشتراک گذاری و مبادله می شود. پایگاه داده ی GeneBank به عنوان جامع ترین پایگاه داده علاوه برفراهم کردن مکانی برای ذخیره سازی اطلاعات، شامل انبوهی از مقالات علمی در زمینه ی زیست شناسی و علوم مرتبط، اطلاعات مربوط بهDNA ژنومی، اطلاعات مربوط به STS، اطلاعات مربوط به GSS، اطلاعات مربوط به EST و … می باشد.

آشنایی با NCBI

NCBI یا همان پایگاه داده ی GeneBank از موتور جستجوی Entrez استفاده می کند که یک سیستم یکپارچه بازیابی اطلاعات می باشد و قادر به جستجوی همزمان در بانک های مختلفی نظیر GeneBank، ژنوم کامل انسان و سایر موجودات، پایگاه داده ی Refseq،  Pubmed، توالی ها و ساختمان پروتئینی، تاکسونومی، پایگاه داده بیماری های ژنتیکی (OMIM) و سایر پایگاه های داده ی مشابه می باشد.

جهت آشنایی با دوره آموزشی بیوانفورماتیک آزمایشگاه ژنیران اینجا کلیک کنید…

از این مطلب چقدر راضی بودید؟

روی ستاره کلیک کنید تا نظرتون ثبت بشه

4.4 / 5. تعداد رای دهندگان: 8

تا حالا امتیازی برای این مطلب ثبت نشده؛ با ثبت نظرتون مارو خوشحال می‌کنید

1 دیدگاه برای “آشنایی با NCBI (بانک های اطلاعاتی و نرم افزارها)

  1. کاربر ژنیران گفته:

    سلام
    من می‌توانم فایل آموزش ddbj را در کوتاه‌ترین زمان داشته باشم

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *